Программа предусматривает изучение особенностей: предоставление водных объектов в пользование на основе договора водопользования; проведение аукциона и выдача решений на предоставление водных объектов в пользование, в том числе моря, а также их использования и охраны; исчисление размера вреда, причиненного водным объектам; оценка эффективности основных водохозяйственных мероприятий по охране водных объектов; разработка нормативов НДС. Кроме того, с учетом выхода новых законодательных актов, программа предусматривает изучение существующих изменений, связанных с осуществлением государственного контроля (в том числе проведение проверок) и защиты прав юридических лиц и индивидуальных предпринимателей. Слушатели обеспечиваются методическими и нормативными материалами.
По результатам обучения выдается удостоверение о повышении квалификации установленного образца.